Le mécanisme de la photosynthèse peut se diviser en deux phases esentielles
(figure 44), indépendantes sur le plan des réactions spécifiques mais
parfaitement coordonnées entre elles grâce aux intermédiaires énergétiques
formés.

Figure 44 : Schéma général de la photosynthèse
dans un chloroplaste
à gauche, la phase photochimique réalisée dans
les membranes des thylakoïdes,
à droite, la phase biochimique représentée par le
cycle de Calvin dans le stroma,
au centre, les intermédiaires, NADP/NADPH et ADP/ATP.
L'ATP est un intermédiaire énergétique qui doit être continuellement reformé
à partir de l'ADP (couple ADP/ATP). Le NADPH est un intermédiaire
d'oxydoréduction qui doit être maintenu continuellement à l'état réduit (couple
NADPH / NADP). En d'autres termes, le NADPH et l'ATP produits par la phase
photochimique permettent la réalisation de la phase biochimique mais leur
régénération par la phase photochimique est indispensable à la poursuite de la
phase biochimique.